激光打標加工技術應用，在醫療行業也是顯而易見的。醫療設備進行激光打標加工的應用是很多的，在不鏽鋼外科手術和牙科設備上打標，這些標記更易讀取，甚至經受消毒的次數可以增加百倍。

最重要的是，它是在絕對光滑麵上打標，可以防止細菌粘著在表麵。經過激光打標加工的表麵不能損害耐腐蝕的化學鈍化處理，才能讓防腐塗層即使經過數年的使用以及無數次的清洗和消毒，也一直存在。

 激光打標加工因為它確保了標記的高質量和高精密度，保證係統的可靠性以及極佳的重複精度。醫療領域的製造商們必定要嚴格遵守既定的工藝流程。

  製造商們如擁有在視覺係統的幫助下可以重複精度的設備，則處於一個有利的位置。一些供應商已經提供配備集成視覺係統的打標機器，能夠檢測出組件位置的變化，檢測出有瑕疵的零件，並自動調整相關的打標。這樣就不再需要或極少需要製造商對標識工作進行調整。激光打標加工技術在醫療行業發揮著重要作用。